賃貸住宅管理業者登録制度の更新をする際に、有効期限が令和9年3月末の賃貸不動産経営管理士または指定講習の修了証書でも手続き可能ですか

手続き可能です。
詳細につきましては、各地方整備局にお問い合わせください。
問合せ先は、下記のサイトをご参考にしてください。
https://www.chintaikanrishi.jp/link